NOTA: Si jugamos la Ronda 1 (por decirlo asi), algunas puertas (generalmente las que conduzcan a algún sector) estarán bloqueadas, impidiendo que obtengamos el 100% (a no ser que os aprendáis los mapas y tracéis una ruta para conseguir todas las expansiones sin tocar UNA SOLA Sala de Navegación), pero al terminar el juego (obteniendo además el icono de la larva Metroide), podemos empezar como quedara nuestra partida previa al combate final y las puertas bloquedas ya estarán libres, pudiendo adquirir el 100% sin volverse loco.
Hemos llegado al final de la historia, reuniremos las últimas expansiones (que para mi sorpresa, me costó menos de lo que esperaba obtenerlas) y por fin iremos a cumplir la última orden de Adam, siendo interceptados por el SA-X en la Cubierta de Operaciones, en un desesperado intento final por detenernos, aunque conseguiremos vencerle y por fin redireccionaremos la estación, echando a correr hacia nuestra nave, dónde nos encontraremos a la larva de Metroide que escapó de la Zona Restringida totalmente evolucionada, lista para servir como el jefe final del juego y una vez muerto, ya podéis decir que habéis superado Metroid Fusion.