Emir Sultan 1368 yılında Ortaasya'da Buhara'da doğmuştu. Devrin çeşitli bilgilerini öğrenmiş bu arada tasavvufla da uğraşmıştı.Buharadan Mekke'ye ve Medine'ye geldi. Buradan da Bağdat yolu ile Anadoluya geçti.Yıldırım Beyazıd bu olgun bilgini birkaç kez ziyaret etmiş sohbetlerinden hoşlanmış kızı Hundi Fatma Hatunu Emir Sultan'a nikâhla bu tanınmış bilgini damat edindi.