Sebelumnya pemasangan pagar ini sempat mendapatkan protes dari warga yang masih bertahan di lokasi proyek. Dua pagar besi milik PT Angkasa Pura yang dipasang di area proyek bandara New Yogyakarta International Airport dirusak orang tak dikenal.
Aparat polisi menduga peristiwa perusakan ini terjadi pada malam hari. Oleh para pekerja proyek pagar ini kemudian dipasang kembali setelah adanya jaminan keamanan dari dari aparat polisi.
Sebelumnya pemasangan pagar besi ini sempat mendapat protes dari para pemilik lahan yang masih bertahan di atas tanah proyek bandara New Yogyakarta International Airport.