30. decembra 1977. se rodio jedan mališan u Požarevcu. Sa 9 godina je pokucao na vrata Partizana, i tu zapravo počinje ova priča.

26.oktobra 1996. je bio pozvan da bude na klupi za prvi tim Partizana protiv Borca iz Čačka. Rezultat na toj utakmici je bio 10-0, a Ilić je debitovao ušavši u drugom poluvremenu. To je bio njegov jedini nastup u toj sezoni, a Partizan je te godine uzeo titulu.

Svoj prvi gol postigao je 23. avgusta 1997. u pobedi nad Vojvodinom na Karađorđu 3-2.

U leto 1998. nakon odlaska Ivana Tomića u Romu, Ilić postaje kapiten sa svega 20 godina. Sa novom ulogom, Ilić postaje jedan od najboljih igrača tima i pomaže crno-belima da stignu do titule nakon jedne godine pauze.

U narednim godinama, Ilić je bio vođa tima i postao miljenik navijača. Postigao je pobedonosni gol u finalu Kupa 2001. u pobedi od 1-0 nad Crvenom zvezdom na Marakani.
Takođe je vodio tim do titula 2002 i 2003. U evropskim okvirima, konačno je uspeo da se domogne Lige šampiona sa Partizanom u sezoni 2003/04, nakon što su crno-beli uspeli da izbace Njukasl posle penala.

U zimu 2004. Ilić je pozajmljen Selti iz Viga na šestomesečni period uz opciju potpisivanja ugovora ukoliko zadovolji. Tadašnji trener Selte je bio Radomir Antić a u napadu je igrao Savo Milošević.

U leto 2004. vratio se sa pozajmice u Partizan i preuzeo kapitensku traku od saigrača Vladimira Ivića koji je napustio tim tog leta. Njegov povratak se poklopio sa povratkom dvojice bivših kapitena Partizana, Dragana Ćirića i Ivana Tomića. Sa iskusnim triom, Partizan je imao sjajnu sezonu, osvojivši prvenstvo bez poraza. 25 pobeda 5 nerešenih 0 poraza.

Nakon uspešnog povratka u Partizan Ilić odlazi u inostranstvo po drugi put u karijeri, potpisavši trogodišnji ugovor sa turskim Galatasarajom u julu 2005. Nakon dolaska ponuđen mu je broj 10 ali je on odbio i uzeo svoj dugogodišnji broj 22. Na svom debiju u ligi, 7. avgusta 2005, postigao je dva gola u pobedi od 2-1 nad Konjasporom. Sa 12 postignutih golova, Ilić je bio treći strelac svog tima tokom sezone 2005/06. pomogavši svom timu da dođe do titule šampiona posle četiri godine pauze.

Imao je sjajan početak sezone 2006/07. postigavši 5 golova u prva 4 kola šampionata. U Ligi šampiona je takođe pružao dobre partije postigavši golove protiv PSV-a i Liverpula, ali je Galatasaraj ipak završio takmičenje kao poslednji u grupi.
Nakon što je trener Red bul Salcburga postao Lotar Mateus (koji je trenirao Ilića u Partizanu), odlučuje da potpiše za austrijski tim. Zvanično je prešao u Salcburg u junu 2007. potpisavši trogodišnji ugovor. Svega nekoliko dana nakon Ilićevog dolaska, Mateus je dobio otkaz.

U januaru 2009. je pozajmljen grčkoj Larisi do kraja sezone 2008/09. Svoj jedini gol je postigao u doigravanju protiv AEK-a iz Atine.
Nakon povratka u Salburg, Ilić je imao malo prilika da igra što mu se desilo prvi put u karijeri. U septembru 2009. klub ga je suspendovao nakon što se kladio na Lacio, protivnika svog kluba u Ligi Evrope Ilić je porekao d