Nach einer furchtbaren Katastrophe, die die gesamte Menschheit tief erschüttert hat, steht die Stadt Kamitsubaki City sieben Jahre später als Beispiel für Hoffnung und Wiederaufbau. Doch Dunkelheit und Gefahr lauern auf die Stadt. Die Tesseractor sind dunkle Kreaturen, geboren aus dem Dunklen in der menschlichen Seele. Fünf Magier-Mädchen, die Witchlings, stellen sich der Bedrohung entgegen.