Infos d'intro: Musique: System of a down - Question! , Durée : 15sec

De retour devant la tache de sang laissée par Meryl, une cutscène et une discussion codec a lieu, mais après ça, Snake repart pour enfin rentrer dans la tour de communication.
Il dois aller dans la tour voisine pour atteindre le Hangar où est stocker le Metal Gear, mais bien sur, cela ne se passera pas sans quelques péripéties...