Le chantier de la chapelle des Jésuites débute en 1667, onze ans après l’achèvement de celui du collège. Initialement prévu pour durer quatre ans, celui-ci va se prolonger jusqu’en 1747, du fait de nombreux conflits avec les pouvoirs locaux. Destinée aux élèves du collège, la chapelle doit également accueillir les fidèles alentours, dans un strict encadrement de la vie religieuse.
Inscrite en 1932 à l’inventaire supplémentaire des monuments historiques, la chapelle a été transformée en auditorium en 1976. Elle abrite depuis 1992 la compagnie de danse Patrick Le Doaré.